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核酸檢測的原理是什么?

時間:2020-07-09 18:10來源:網(wǎng)絡(luò)整理 瀏覽:
瘟疫和病毒的知識與人類日常生活息息相關(guān),從獲得健康長壽的生命,到提高生活質(zhì)量,再到下一代的遺傳和養(yǎng)育,這其中的答案,其實都與生命科學(xué)息息相關(guān)

瘟疫和病毒的知識與人類日常生活息息相關(guān),從獲得健康長壽的生命,到提高生活質(zhì)量,再到下一代的遺傳和養(yǎng)育,這其中的答案,其實都與生命科學(xué)息息相關(guān)。

隨著新冠肺炎的爆發(fā),核酸檢測”這種醫(yī)學(xué)檢測手法也進(jìn)入了大眾的視野。那么,核酸檢測的原理是什么?為什么核酸檢測會有一定幾率出錯?面對新發(fā)感染性疾病,人類還有更先進(jìn)的病原體檢測手法嗎?

華大基因CEO、《生命密碼2》作者尹燁就在他的新書中為我們講述了病原檢測的過去與未來。

核酸檢測的原理是什么?


核酸檢測的原理是什么?

1953 年 DNA 雙螺旋結(jié)構(gòu)的發(fā)現(xiàn),開啟了分子生物學(xué)時代,使人類對病原體的研究從形態(tài)學(xué)層次深入到分子層次。

基于分子水平的核酸檢測技術(shù)漸漸成為病原體檢測的主流,它不必預(yù)先對病原體進(jìn)行分離培養(yǎng)便可直接檢測,方便快捷,而且靈敏度更高。

核酸檢測的原理是什么?


圖:信息時報 陸明杰 攝

核酸檢測技術(shù)是基于核酸雙鏈互補配對原則的核酸雜交技術(shù),技術(shù)人員合成一段與特定病原體 DNA 或者 RNA 互補的單鏈核酸序列作為探針,并用生物素、放射性同位素、酶等進(jìn)行標(biāo)記,讓其與待測病原體的核酸進(jìn)行雜交。

如果探針能與待測病原體的核酸互補配對,便能觀察到標(biāo)記物的信號,這樣就可以證實待測病原體的種類。

這類檢測技術(shù)的特異度和靈敏度均較高,對感染性疾病的早期診斷有至關(guān)重要的意義。

核酸檢測的原理是什么?


示意圖:探針與病原體核酸互補結(jié)合后,探針上的標(biāo)記物便會顯色,通過觀察病原體樣本是否顯色即可確定病原體的種類(繪圖:李靖)

然而,有時因為患者體內(nèi)的病原體核酸含量過低,檢測時會有一定的難度。20 世紀(jì)八九十年代,PCR 技術(shù)的應(yīng)用使待檢測的病原體核酸數(shù)量可以成千上萬地擴增,大大提高了核酸檢測技術(shù)的應(yīng)用性和準(zhǔn)確性。

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病原體免疫檢測技術(shù)進(jìn)化史

在古代,人們把大范圍暴發(fā)的感染性疾病稱為瘟疫,“醫(yī)圣”張仲景在其著作《傷寒雜病論》中提到:

“建安元年,丙子年,南陽自此連年疾疫,不到十年之間,張仲景宗族兩百余口,死者竟達(dá)三分之二?!?/p>

肉眼一般只能看到直徑大于 100 微米(0.1 毫米)的物體,而絕大多數(shù)病原體微生物至多是這個尺度的五十分之一,因此古代醫(yī)生無法鑒別引發(fā)瘟疫的病原體,只能通過“望聞問切”等方法觀察患者癥狀來確定所患的是何種疾病,從而對癥治療。

核酸檢測的原理是什么?


圖:紀(jì)錄片《本草中華》

1670 年,安東尼 · 列文虎克(Antony van Leeuwenhoek)改進(jìn)了顯微鏡?;陲@微鏡技術(shù)的微生物學(xué)、寄生蟲學(xué)等學(xué)科相繼誕生,并催生了病原檢測技術(shù)。

19 世紀(jì)的德國細(xì)菌學(xué)家羅伯特 · 科赫(Robert Koch)是病原微生物學(xué)的開拓者。他發(fā)明了用苯胺對細(xì)菌進(jìn)行染色的細(xì)菌染色法,以及微生物的固體培養(yǎng)基培養(yǎng)法和懸滴培養(yǎng)法。

科赫提出了著名的科赫法則(Koch’s Postulates): 對于某種感染性疾病,如果每一個患者體內(nèi)都能找到同樣的微生物,再把這種微生物提取、培養(yǎng)后,接種到健康宿主體內(nèi)能引起相同的病癥,而且被感染的宿主體內(nèi)能提取到這種微生物,就說明這種微生物是感染性疾病的病原體。

在科赫的理論上發(fā)展起來的現(xiàn)代病原體檢測方法包括涂片染色后顯微鏡觀察和病原體培養(yǎng)檢測。這兩種方法簡便易行,是極為常用的病原體檢測方法。

核酸檢測的原理是什么?


愛德華·詹納醫(yī)生為人接種“牛痘”。(圖片來自網(wǎng)絡(luò))

隨著十八、十九世紀(jì)牛痘疫苗、炭疽疫苗和狂犬疫苗等疫苗的發(fā)明,人類對免疫機制的研究越來越深入。

基于免疫學(xué)中的抗體與抗原特異性結(jié)合的原理,多種免疫檢測技術(shù)相繼誕生,在病原體免疫檢測中,根據(jù)患者體內(nèi)的病原體能否與特定抗體結(jié)合,便可判斷病原體的種類。

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假如病毒再度變異

更好的檢測方式是什么?

測序技術(shù)發(fā)明后,人類獲得了窺探生命遺傳本質(zhì)的能力,自此步入基因組學(xué)時代。而 20 世紀(jì) 70 年代 DNA 測序技術(shù)的發(fā)明,為感染性疾病的精準(zhǔn)診斷和精準(zhǔn)治療奠定了基礎(chǔ)。

近幾十年來新發(fā)感染性疾病不斷增加,現(xiàn)有病原體經(jīng)過變異形成新的病原體,原先未被發(fā)現(xiàn)的病原體入侵人類社會。

核酸檢測的原理是什么?


SARS病毒顯微鏡照片 圖/NIH Image Gallery / Flickr

部分新發(fā)感染性疾病如非典等,傳播速度快、波及范圍廣,具有嚴(yán)重的社會危害性。而人類對新發(fā)感染性疾病所知不多,在疾病出現(xiàn)之初不但缺乏成熟的防治方法,有時甚至難以診斷其病原體。

在這種情況下,運用 mNGS 技術(shù)可以幫助醫(yī)生對新發(fā)、疑難感染性疾病進(jìn)行診斷,快速明確感染病原,及時對患者進(jìn)行精準(zhǔn)治療。

2017 年 6 月,一位菲律賓籍船員在唐山港口出現(xiàn)頭痛、意識障礙、左半身偏癱的癥狀。

院方和華大基因采用 mNGS 技術(shù),僅用了 30 個小時便從患者腦脊液樣本中檢出結(jié)核桿菌,證明患者感染的是結(jié)核性腦膜炎。明確病原之后,院方立即進(jìn)行了針對性治療,患者于 7 月中旬順利出院回國。

感染性疾病的傳統(tǒng)檢測技術(shù)對實驗室場地建設(shè)、儀器設(shè)備、從業(yè)人員等有很高的要求。

與之相比,即時檢測(point of care testing, POCT)技術(shù)將各種專業(yè)檢測技術(shù)整合到一個小型機器中,操作簡易,非專業(yè)檢測人員也可進(jìn)行操作;檢測場地也不受限制,在家庭、公共場所都能進(jìn)行檢測;檢測速度快,患者能得到及時的診斷和治療。

未來的即時檢測的檢測設(shè)備將向小型化、自動化、簡易化的趨勢發(fā)展。

核酸檢測的原理是什么?


病原檢測技術(shù)的發(fā)展前景

隨著技術(shù)的發(fā)展,檢測對象已經(jīng)從病原體個體水平深入到分子水平,并進(jìn)一步深入到 DNA 單堿基差異水平;病原體特性鑒定從種屬水平到單個病原體水平及其耐藥屬性,甚至到微生物群體水平;病原體檢測范圍從常見性病原擴展到少見、罕見性病原,從細(xì)菌病毒擴展到全部微生物甚至寄生蟲;診斷模式也將從醫(yī)生經(jīng)驗性的假設(shè)診斷到不需要提前預(yù)設(shè)病原體的數(shù)據(jù)診斷。

這些進(jìn)步都為現(xiàn)代感染性疾病的精準(zhǔn)預(yù)防、精準(zhǔn)診斷和精準(zhǔn)治療提供了保障。

展望未來,感染檢測技術(shù)的發(fā)展重點會向著更準(zhǔn)確、更快速、更便宜和更便捷的方向發(fā)展。

隨著分子診斷技術(shù),特別是測序技術(shù)成本的進(jìn)一步降低以及檢測速度和性能的進(jìn)一步提高,再復(fù)雜的病原診斷也將不再困難,人類對于微生物的認(rèn)知也將更加全面、更加清晰,傳染、感染疾病的精準(zhǔn)醫(yī)療時代即將全面到來。

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